يهدف الديوان الى ضمان سلامة العمل والاستقرار المالي والإداري في دولة فلسطين بسلطاتها الثلاث التنفيذية والتشريعية والقضائية وكشف أوجه كافة أشكال الانحراف المالي والإداري بما فيها حالات استغلال الوظيفة العامة ويهدف أيضا الى التأكد من أن الأداء العام في فلسطين يتفق مع أحكام القوانين والأنظمة واللوائح والقرارات والتعليمات النافذة وفي حدودها وانه يمارس باقتصاد وكفاءة وفاعلية.

يحرص الديوان على تطوير علاقته مع الجهات الإدارية والأطراف ذات العلاقة لتمتاز بالمهنية والشفافية والوضوح بما يخدم جودة المنتج الرقابي الذي يسهم في رفع وتحسين الأداء والحفاظ على المال العام في فلسطين ويسعى الديوان للتحسين المستمر وملتزم بالتطور نحو الأفضل وبما يتوافق مع معايير منظمة الانتوساي (المنظمة العالمية للأجهزة العليا للرقابة والمحاسبة ) ومعايير التدقيق الدولية بهدف الوصول الى منتج رقابي ذات جودة عالية ، وتعزيزاً لحضور فلسطين في الساحة العربية والدولية يمتلك الديوان شبكة علاقات خارجية مهنية وواسعة مع مختلف المؤسسات والمنظمات والأجهزة النظيرة بهدف تطوير قدراته المهنية ومخرجات أعماله.